Vor 10000 Jahren führten die Menschen ein ganz anderes Leben als heute. Sie lebten in einfachen Hütten, gingen auf die Jagd oder sammelten Beeren, Pilze und andere Früchte. Sie richteten ihr Leben ganz nach der Natur aus. Bei Einbruch der Dunkelheit versammelten sie sich am Lagerfeuer, wo es hell und warm war. Zu dieser Zeit lebten auch der kleine Junge Jono und seine ältere Schwester Jada. Mit Stone Age Junior tauchen Kinder ab 5 Jahren in die Welt von Jono und Jade ein. Sie laufen durch das Tal und sammeln verschiedene Waren, die wiederum zum Wachstum der Siedlung beitragen können. Wer am Ende drei Hütten gebaut hat, gewinnt das Spiel.